Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF260Q3ZCT1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF260Q3ZCT1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF260Q3ZCT1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF260Q3ZCT1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF260Q3ZCT1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF260Q3ZCT1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF260Q3ZCT1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF260Q3ZCT1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF260Q3ZCT1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF260Q3ZCT1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF260Q3ZCT1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF260Q3ZCT1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF260Q3ZCT1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF260Q3ZCT1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF260Q3ZCT1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF260Q3ZCT1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF260Q3ZCT1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF260Q3ZCT1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF260Q3ZCT1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF260Q3ZCT1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF260Q3ZCT1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF260Q3ZCT1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF260Q3ZCT1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF260Q3ZCT1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF260Q3ZCT1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF260Q3ZCT1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF260Q3ZCT1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF260Q3ZCT1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF260Q3ZCT1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF260Q3ZCT1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF260Q3ZCT1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF260Q3ZCT1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF260Q3ZCT1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF260Q3ZCT1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF260Q3ZCT1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF260Q3ZCT1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF260Q3ZCT1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF260Q3ZCT1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF260Q3ZCT1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF260Q3ZCT1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF260Q3ZCT1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms