Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRTAP27-1Q3LI81 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRTAP27-1Q3LI81 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRTAP27-1Q3LI81 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRTAP27-1Q3LI81 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRTAP27-1Q3LI81 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRTAP27-1Q3LI81 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRTAP27-1Q3LI81 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRTAP27-1Q3LI81 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRTAP27-1Q3LI81 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRTAP27-1Q3LI81 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRTAP27-1Q3LI81 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRTAP27-1Q3LI81 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP27-1Q3LI81 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP27-1Q3LI81 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP27-1Q3LI81 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRTAP27-1Q3LI81 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRTAP27-1Q3LI81 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRTAP27-1Q3LI81 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRTAP27-1Q3LI81 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRTAP27-1Q3LI81 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRTAP27-1Q3LI81 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRTAP27-1Q3LI81 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRTAP27-1Q3LI81 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRTAP27-1Q3LI81 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRTAP27-1Q3LI81 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRTAP27-1Q3LI81 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP27-1Q3LI81 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP27-1Q3LI81 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP27-1Q3LI81 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP27-1Q3LI81 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRTAP27-1Q3LI81 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRTAP27-1Q3LI81 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRTAP27-1Q3LI81 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRTAP27-1Q3LI81 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRTAP27-1Q3LI81 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRTAP27-1Q3LI81 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRTAP27-1Q3LI81 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRTAP27-1Q3LI81 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRTAP27-1Q3LI81 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRTAP27-1Q3LI81 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP27-1Q3LI81 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP27-1Q3LI81 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP27-1Q3LI81 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRTAP27-1Q3LI81 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTAP27-1Q3LI81 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTAP27-1Q3LI81 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRTAP27-1Q3LI81 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRTAP27-1Q3LI81 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRTAP27-1Q3LI81 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTAP27-1Q3LI81 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRTAP27-1Q3LI81 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTAP27-1Q3LI81 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTAP27-1Q3LI81 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRTAP27-1Q3LI81 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRTAP27-1Q3LI81 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTAP27-1Q3LI81 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRTAP27-1Q3LI81 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms