Protein–RNA interactions for Protein: Q38SD2

LRRK1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1Q38SD2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRK1Q38SD2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRK1Q38SD2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRK1Q38SD2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRK1Q38SD2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRK1Q38SD2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRK1Q38SD2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRK1Q38SD2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRK1Q38SD2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRK1Q38SD2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRK1Q38SD2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRK1Q38SD2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRK1Q38SD2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRK1Q38SD2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRK1Q38SD2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRK1Q38SD2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRK1Q38SD2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRK1Q38SD2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRK1Q38SD2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRK1Q38SD2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRK1Q38SD2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRK1Q38SD2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRK1Q38SD2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRK1Q38SD2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRK1Q38SD2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRK1Q38SD2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRK1Q38SD2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRK1Q38SD2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRK1Q38SD2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRK1Q38SD2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRK1Q38SD2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRK1Q38SD2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRK1Q38SD2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRK1Q38SD2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRK1Q38SD2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRK1Q38SD2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRK1Q38SD2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRK1Q38SD2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRK1Q38SD2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRK1Q38SD2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRK1Q38SD2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRK1Q38SD2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRK1Q38SD2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRK1Q38SD2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRK1Q38SD2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRK1Q38SD2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRK1Q38SD2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRK1Q38SD2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRK1Q38SD2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRK1Q38SD2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRK1Q38SD2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRK1Q38SD2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRK1Q38SD2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRK1Q38SD2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRK1Q38SD2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms