Protein–RNA interactions for Protein: Q32M88

PGGHG, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGHGQ32M88 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGGHGQ32M88 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGGHGQ32M88 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGGHGQ32M88 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGGHGQ32M88 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGGHGQ32M88 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGGHGQ32M88 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGGHGQ32M88 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGGHGQ32M88 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGGHGQ32M88 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGGHGQ32M88 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGGHGQ32M88 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGGHGQ32M88 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGGHGQ32M88 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGGHGQ32M88 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGGHGQ32M88 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGGHGQ32M88 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGGHGQ32M88 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGGHGQ32M88 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGGHGQ32M88 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGGHGQ32M88 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGGHGQ32M88 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGGHGQ32M88 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGGHGQ32M88 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGGHGQ32M88 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGGHGQ32M88 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGGHGQ32M88 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGGHGQ32M88 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGGHGQ32M88 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGHGQ32M88 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGGHGQ32M88 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGGHGQ32M88 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGGHGQ32M88 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGGHGQ32M88 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGGHGQ32M88 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGGHGQ32M88 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PGGHGQ32M88 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGGHGQ32M88 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGGHGQ32M88 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGGHGQ32M88 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PGGHGQ32M88 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGGHGQ32M88 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGGHGQ32M88 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGGHGQ32M88 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGGHGQ32M88 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGGHGQ32M88 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGHGQ32M88 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGHGQ32M88 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGHGQ32M88 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGGHGQ32M88 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGGHGQ32M88 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGGHGQ32M88 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGGHGQ32M88 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGGHGQ32M88 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGGHGQ32M88 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGGHGQ32M88 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGGHGQ32M88 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGGHGQ32M88 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms