Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
FHOD3Q2V2M9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.77■■■■■ 4.6
FHOD3Q2V2M9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
FHOD3Q2V2M9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
FHOD3Q2V2M9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
FHOD3Q2V2M9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
FHOD3Q2V2M9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
FHOD3Q2V2M9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
FHOD3Q2V2M9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
FHOD3Q2V2M9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
FHOD3Q2V2M9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
FHOD3Q2V2M9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
FHOD3Q2V2M9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
FHOD3Q2V2M9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
FHOD3Q2V2M9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.61■■■■■ 4.57
FHOD3Q2V2M9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
FHOD3Q2V2M9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
FHOD3Q2V2M9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
FHOD3Q2V2M9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
FHOD3Q2V2M9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC43.57■■■■■ 4.57
FHOD3Q2V2M9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
FHOD3Q2V2M9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
FHOD3Q2V2M9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
FHOD3Q2V2M9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
FHOD3Q2V2M9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
FHOD3Q2V2M9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
FHOD3Q2V2M9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
FHOD3Q2V2M9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.48■■■■■ 4.55
FHOD3Q2V2M9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
FHOD3Q2V2M9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
FHOD3Q2V2M9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
FHOD3Q2V2M9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
FHOD3Q2V2M9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
FHOD3Q2V2M9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
FHOD3Q2V2M9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
FHOD3Q2V2M9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
FHOD3Q2V2M9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
FHOD3Q2V2M9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.44■■■■■ 4.54
FHOD3Q2V2M9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
FHOD3Q2V2M9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
FHOD3Q2V2M9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
FHOD3Q2V2M9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
FHOD3Q2V2M9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
FHOD3Q2V2M9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
FHOD3Q2V2M9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
FHOD3Q2V2M9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
FHOD3Q2V2M9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
FHOD3Q2V2M9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
FHOD3Q2V2M9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
FHOD3Q2V2M9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
FHOD3Q2V2M9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
FHOD3Q2V2M9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
FHOD3Q2V2M9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
FHOD3Q2V2M9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
FHOD3Q2V2M9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
FHOD3Q2V2M9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
FHOD3Q2V2M9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
FHOD3Q2V2M9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
FHOD3Q2V2M9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
FHOD3Q2V2M9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
FHOD3Q2V2M9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
FHOD3Q2V2M9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
FHOD3Q2V2M9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
FHOD3Q2V2M9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
FHOD3Q2V2M9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.3■■■■■ 4.52
FHOD3Q2V2M9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
FHOD3Q2V2M9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
FHOD3Q2V2M9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
FHOD3Q2V2M9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
FHOD3Q2V2M9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC43.21■■■■■ 4.51
FHOD3Q2V2M9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
FHOD3Q2V2M9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
FHOD3Q2V2M9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
FHOD3Q2V2M9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.51
FHOD3Q2V2M9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
FHOD3Q2V2M9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
FHOD3Q2V2M9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
FHOD3Q2V2M9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
FHOD3Q2V2M9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
FHOD3Q2V2M9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
FHOD3Q2V2M9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
FHOD3Q2V2M9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
FHOD3Q2V2M9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
FHOD3Q2V2M9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
FHOD3Q2V2M9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
FHOD3Q2V2M9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
FHOD3Q2V2M9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
FHOD3Q2V2M9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
FHOD3Q2V2M9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
FHOD3Q2V2M9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms