Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMU1Q2TAY7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMU1Q2TAY7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMU1Q2TAY7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMU1Q2TAY7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMU1Q2TAY7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMU1Q2TAY7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMU1Q2TAY7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMU1Q2TAY7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMU1Q2TAY7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMU1Q2TAY7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMU1Q2TAY7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMU1Q2TAY7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMU1Q2TAY7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMU1Q2TAY7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMU1Q2TAY7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMU1Q2TAY7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMU1Q2TAY7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMU1Q2TAY7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMU1Q2TAY7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMU1Q2TAY7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMU1Q2TAY7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMU1Q2TAY7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMU1Q2TAY7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMU1Q2TAY7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMU1Q2TAY7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMU1Q2TAY7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMU1Q2TAY7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMU1Q2TAY7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMU1Q2TAY7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMU1Q2TAY7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMU1Q2TAY7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMU1Q2TAY7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMU1Q2TAY7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMU1Q2TAY7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMU1Q2TAY7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMU1Q2TAY7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMU1Q2TAY7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMU1Q2TAY7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMU1Q2TAY7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMU1Q2TAY7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMU1Q2TAY7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMU1Q2TAY7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMU1Q2TAY7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMU1Q2TAY7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMU1Q2TAY7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMU1Q2TAY7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMU1Q2TAY7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMU1Q2TAY7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMU1Q2TAY7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMU1Q2TAY7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMU1Q2TAY7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMU1Q2TAY7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMU1Q2TAY7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMU1Q2TAY7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMU1Q2TAY7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMU1Q2TAY7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMU1Q2TAY7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMU1Q2TAY7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMU1Q2TAY7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMU1Q2TAY7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMU1Q2TAY7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMU1Q2TAY7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMU1Q2TAY7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMU1Q2TAY7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMU1Q2TAY7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMU1Q2TAY7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms