Protein–RNA interactions for Protein: Q1HG43

DUOXA1, Dual oxidase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOXA1Q1HG43 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOXA1Q1HG43 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOXA1Q1HG43 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOXA1Q1HG43 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOXA1Q1HG43 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOXA1Q1HG43 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOXA1Q1HG43 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOXA1Q1HG43 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOXA1Q1HG43 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUOXA1Q1HG43 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUOXA1Q1HG43 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUOXA1Q1HG43 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUOXA1Q1HG43 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DUOXA1Q1HG43 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DUOXA1Q1HG43 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUOXA1Q1HG43 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOXA1Q1HG43 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOXA1Q1HG43 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOXA1Q1HG43 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUOXA1Q1HG43 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOXA1Q1HG43 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUOXA1Q1HG43 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOXA1Q1HG43 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOXA1Q1HG43 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUOXA1Q1HG43 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUOXA1Q1HG43 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DUOXA1Q1HG43 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DUOXA1Q1HG43 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DUOXA1Q1HG43 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DUOXA1Q1HG43 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DUOXA1Q1HG43 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DUOXA1Q1HG43 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DUOXA1Q1HG43 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DUOXA1Q1HG43 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOXA1Q1HG43 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOXA1Q1HG43 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOXA1Q1HG43 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOXA1Q1HG43 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOXA1Q1HG43 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOXA1Q1HG43 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOXA1Q1HG43 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOXA1Q1HG43 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOXA1Q1HG43 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOXA1Q1HG43 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOXA1Q1HG43 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOXA1Q1HG43 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOXA1Q1HG43 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOXA1Q1HG43 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOXA1Q1HG43 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOXA1Q1HG43 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOXA1Q1HG43 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOXA1Q1HG43 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOXA1Q1HG43 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOXA1Q1HG43 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOXA1Q1HG43 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOXA1Q1HG43 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOXA1Q1HG43 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOXA1Q1HG43 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOXA1Q1HG43 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOXA1Q1HG43 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOXA1Q1HG43 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUOXA1Q1HG43 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DUOXA1Q1HG43 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOXA1Q1HG43 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOXA1Q1HG43 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DUOXA1Q1HG43 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms