Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIST2H2ACQ16777 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIST2H2ACQ16777 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIST2H2ACQ16777 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIST2H2ACQ16777 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIST2H2ACQ16777 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIST2H2ACQ16777 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIST2H2ACQ16777 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIST2H2ACQ16777 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIST2H2ACQ16777 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIST2H2ACQ16777 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIST2H2ACQ16777 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIST2H2ACQ16777 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIST2H2ACQ16777 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIST2H2ACQ16777 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HIST2H2ACQ16777 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HIST2H2ACQ16777 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIST2H2ACQ16777 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIST2H2ACQ16777 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIST2H2ACQ16777 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIST2H2ACQ16777 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIST2H2ACQ16777 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIST2H2ACQ16777 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIST2H2ACQ16777 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIST2H2ACQ16777 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIST2H2ACQ16777 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIST2H2ACQ16777 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIST2H2ACQ16777 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIST2H2ACQ16777 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIST2H2ACQ16777 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HIST2H2ACQ16777 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIST2H2ACQ16777 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIST2H2ACQ16777 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIST2H2ACQ16777 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIST2H2ACQ16777 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIST2H2ACQ16777 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIST2H2ACQ16777 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIST2H2ACQ16777 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIST2H2ACQ16777 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIST2H2ACQ16777 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIST2H2ACQ16777 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIST2H2ACQ16777 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIST2H2ACQ16777 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIST2H2ACQ16777 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIST2H2ACQ16777 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIST2H2ACQ16777 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIST2H2ACQ16777 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIST2H2ACQ16777 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIST2H2ACQ16777 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIST2H2ACQ16777 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HIST2H2ACQ16777 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIST2H2ACQ16777 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIST2H2ACQ16777 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIST2H2ACQ16777 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIST2H2ACQ16777 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIST2H2ACQ16777 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIST2H2ACQ16777 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIST2H2ACQ16777 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIST2H2ACQ16777 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIST2H2ACQ16777 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIST2H2ACQ16777 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIST2H2ACQ16777 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIST2H2ACQ16777 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIST2H2ACQ16777 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIST2H2ACQ16777 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIST2H2ACQ16777 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIST2H2ACQ16777 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms