Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLPPQ16740 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLPPQ16740 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLPPQ16740 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLPPQ16740 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLPPQ16740 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLPPQ16740 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLPPQ16740 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLPPQ16740 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLPPQ16740 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLPPQ16740 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLPPQ16740 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLPPQ16740 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLPPQ16740 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLPPQ16740 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLPPQ16740 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLPPQ16740 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLPPQ16740 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLPPQ16740 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLPPQ16740 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLPPQ16740 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CLPPQ16740 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLPPQ16740 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLPPQ16740 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLPPQ16740 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLPPQ16740 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLPPQ16740 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLPPQ16740 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLPPQ16740 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLPPQ16740 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLPPQ16740 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLPPQ16740 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLPPQ16740 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLPPQ16740 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLPPQ16740 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLPPQ16740 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLPPQ16740 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLPPQ16740 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLPPQ16740 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLPPQ16740 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLPPQ16740 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLPPQ16740 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLPPQ16740 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLPPQ16740 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLPPQ16740 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLPPQ16740 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLPPQ16740 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLPPQ16740 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLPPQ16740 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLPPQ16740 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLPPQ16740 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLPPQ16740 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLPPQ16740 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLPPQ16740 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
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