Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATP2B3Q16720 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATP2B3Q16720 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ATP2B3Q16720 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
ATP2B3Q16720 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATP2B3Q16720 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATP2B3Q16720 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP2B3Q16720 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATP2B3Q16720 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATP2B3Q16720 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP2B3Q16720 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP2B3Q16720 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATP2B3Q16720 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
ATP2B3Q16720 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ATP2B3Q16720 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATP2B3Q16720 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATP2B3Q16720 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATP2B3Q16720 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP2B3Q16720 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP2B3Q16720 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP2B3Q16720 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP2B3Q16720 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ATP2B3Q16720 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATP2B3Q16720 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATP2B3Q16720 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATP2B3Q16720 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP2B3Q16720 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP2B3Q16720 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
ATP2B3Q16720 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATP2B3Q16720 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATP2B3Q16720 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATP2B3Q16720 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP2B3Q16720 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP2B3Q16720 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATP2B3Q16720 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ATP2B3Q16720 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP2B3Q16720 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP2B3Q16720 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP2B3Q16720 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP2B3Q16720 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP2B3Q16720 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP2B3Q16720 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP2B3Q16720 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP2B3Q16720 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP2B3Q16720 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP2B3Q16720 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP2B3Q16720 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATP2B3Q16720 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP2B3Q16720 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP2B3Q16720 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP2B3Q16720 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP2B3Q16720 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP2B3Q16720 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP2B3Q16720 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP2B3Q16720 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP2B3Q16720 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP2B3Q16720 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP2B3Q16720 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP2B3Q16720 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP2B3Q16720 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP2B3Q16720 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP2B3Q16720 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP2B3Q16720 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP2B3Q16720 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP2B3Q16720 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP2B3Q16720 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP2B3Q16720 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP2B3Q16720 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP2B3Q16720 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP2B3Q16720 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP2B3Q16720 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP2B3Q16720 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP2B3Q16720 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATP2B3Q16720 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATP2B3Q16720 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATP2B3Q16720 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATP2B3Q16720 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATP2B3Q16720 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ATP2B3Q16720 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ATP2B3Q16720 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ATP2B3Q16720 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATP2B3Q16720 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATP2B3Q16720 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATP2B3Q16720 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
ATP2B3Q16720 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATP2B3Q16720 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATP2B3Q16720 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATP2B3Q16720 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATP2B3Q16720 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATP2B3Q16720 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATP2B3Q16720 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATP2B3Q16720 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATP2B3Q16720 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP2B3Q16720 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP2B3Q16720 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP2B3Q16720 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP2B3Q16720 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATP2B3Q16720 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATP2B3Q16720 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATP2B3Q16720 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms