Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
FOXD1Q16676 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
FOXD1Q16676 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
FOXD1Q16676 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
FOXD1Q16676 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
FOXD1Q16676 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
FOXD1Q16676 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
FOXD1Q16676 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.02■■■■■ 4
FOXD1Q16676 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
FOXD1Q16676 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
FOXD1Q16676 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40■■■■□ 3.99
FOXD1Q16676 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
FOXD1Q16676 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
FOXD1Q16676 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
FOXD1Q16676 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
FOXD1Q16676 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
FOXD1Q16676 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
FOXD1Q16676 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
FOXD1Q16676 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
FOXD1Q16676 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
FOXD1Q16676 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
FOXD1Q16676 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
FOXD1Q16676 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
FOXD1Q16676 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
FOXD1Q16676 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
FOXD1Q16676 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
FOXD1Q16676 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
FOXD1Q16676 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
FOXD1Q16676 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
FOXD1Q16676 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
FOXD1Q16676 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
FOXD1Q16676 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
FOXD1Q16676 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
FOXD1Q16676 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
FOXD1Q16676 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
FOXD1Q16676 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
FOXD1Q16676 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
FOXD1Q16676 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
FOXD1Q16676 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
FOXD1Q16676 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
FOXD1Q16676 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
FOXD1Q16676 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
FOXD1Q16676 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
FOXD1Q16676 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
FOXD1Q16676 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
FOXD1Q16676 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
FOXD1Q16676 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
FOXD1Q16676 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
FOXD1Q16676 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
FOXD1Q16676 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
FOXD1Q16676 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
FOXD1Q16676 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
FOXD1Q16676 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
FOXD1Q16676 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC39.65■■■■□ 3.94
FOXD1Q16676 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
FOXD1Q16676 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
FOXD1Q16676 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
FOXD1Q16676 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
FOXD1Q16676 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
FOXD1Q16676 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
FOXD1Q16676 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
FOXD1Q16676 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
FOXD1Q16676 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
FOXD1Q16676 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
FOXD1Q16676 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
FOXD1Q16676 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
FOXD1Q16676 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
FOXD1Q16676 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
FOXD1Q16676 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
FOXD1Q16676 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
FOXD1Q16676 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
FOXD1Q16676 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
FOXD1Q16676 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
FOXD1Q16676 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
FOXD1Q16676 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
FOXD1Q16676 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
FOXD1Q16676 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
FOXD1Q16676 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
FOXD1Q16676 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
FOXD1Q16676 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
FOXD1Q16676 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
FOXD1Q16676 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
FOXD1Q16676 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
FOXD1Q16676 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
FOXD1Q16676 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
FOXD1Q16676 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
FOXD1Q16676 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
FOXD1Q16676 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
FOXD1Q16676 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
FOXD1Q16676 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
FOXD1Q16676 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
FOXD1Q16676 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
FOXD1Q16676 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
FOXD1Q16676 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
FOXD1Q16676 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
FOXD1Q16676 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
FOXD1Q16676 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
FOXD1Q16676 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
FOXD1Q16676 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
FOXD1Q16676 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms