Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NFIL3Q16649 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NFIL3Q16649 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIL3Q16649 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFIL3Q16649 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFIL3Q16649 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFIL3Q16649 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NFIL3Q16649 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFIL3Q16649 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFIL3Q16649 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFIL3Q16649 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFIL3Q16649 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIL3Q16649 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIL3Q16649 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NFIL3Q16649 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NFIL3Q16649 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFIL3Q16649 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFIL3Q16649 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFIL3Q16649 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFIL3Q16649 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIL3Q16649 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIL3Q16649 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIL3Q16649 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIL3Q16649 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIL3Q16649 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIL3Q16649 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFIL3Q16649 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFIL3Q16649 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NFIL3Q16649 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NFIL3Q16649 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFIL3Q16649 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFIL3Q16649 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFIL3Q16649 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFIL3Q16649 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFIL3Q16649 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFIL3Q16649 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFIL3Q16649 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFIL3Q16649 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFIL3Q16649 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFIL3Q16649 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFIL3Q16649 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFIL3Q16649 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFIL3Q16649 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIL3Q16649 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIL3Q16649 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIL3Q16649 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFIL3Q16649 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFIL3Q16649 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFIL3Q16649 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFIL3Q16649 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFIL3Q16649 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFIL3Q16649 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFIL3Q16649 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFIL3Q16649 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFIL3Q16649 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFIL3Q16649 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFIL3Q16649 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NFIL3Q16649 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFIL3Q16649 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIL3Q16649 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIL3Q16649 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFIL3Q16649 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFIL3Q16649 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFIL3Q16649 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIL3Q16649 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIL3Q16649 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIL3Q16649 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFIL3Q16649 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFIL3Q16649 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFIL3Q16649 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NFIL3Q16649 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFIL3Q16649 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFIL3Q16649 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFIL3Q16649 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFIL3Q16649 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFIL3Q16649 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFIL3Q16649 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFIL3Q16649 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFIL3Q16649 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFIL3Q16649 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFIL3Q16649 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFIL3Q16649 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFIL3Q16649 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFIL3Q16649 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms