Protein–RNA interactions for Protein: Q16609

LPAL2, Putative apolipoprotein(a)-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAL2Q16609 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LPAL2Q16609 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LPAL2Q16609 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
LPAL2Q16609 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
LPAL2Q16609 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LPAL2Q16609 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LPAL2Q16609 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LPAL2Q16609 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LPAL2Q16609 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LPAL2Q16609 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LPAL2Q16609 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LPAL2Q16609 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LPAL2Q16609 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LPAL2Q16609 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LPAL2Q16609 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LPAL2Q16609 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LPAL2Q16609 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LPAL2Q16609 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LPAL2Q16609 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LPAL2Q16609 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LPAL2Q16609 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LPAL2Q16609 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LPAL2Q16609 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LPAL2Q16609 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LPAL2Q16609 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LPAL2Q16609 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LPAL2Q16609 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LPAL2Q16609 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LPAL2Q16609 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LPAL2Q16609 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LPAL2Q16609 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LPAL2Q16609 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LPAL2Q16609 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LPAL2Q16609 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LPAL2Q16609 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPAL2Q16609 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPAL2Q16609 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LPAL2Q16609 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LPAL2Q16609 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LPAL2Q16609 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LPAL2Q16609 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LPAL2Q16609 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LPAL2Q16609 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LPAL2Q16609 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LPAL2Q16609 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LPAL2Q16609 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LPAL2Q16609 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LPAL2Q16609 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LPAL2Q16609 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LPAL2Q16609 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LPAL2Q16609 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LPAL2Q16609 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LPAL2Q16609 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LPAL2Q16609 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LPAL2Q16609 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LPAL2Q16609 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LPAL2Q16609 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPAL2Q16609 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPAL2Q16609 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LPAL2Q16609 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LPAL2Q16609 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LPAL2Q16609 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LPAL2Q16609 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LPAL2Q16609 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LPAL2Q16609 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms