Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRR4Q16378 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRR4Q16378 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRR4Q16378 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRR4Q16378 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRR4Q16378 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRR4Q16378 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRR4Q16378 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRR4Q16378 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRR4Q16378 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRR4Q16378 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRR4Q16378 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRR4Q16378 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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