Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRK1Q15835 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRK1Q15835 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRK1Q15835 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRK1Q15835 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRK1Q15835 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRK1Q15835 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRK1Q15835 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRK1Q15835 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRK1Q15835 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRK1Q15835 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRK1Q15835 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRK1Q15835 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRK1Q15835 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRK1Q15835 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRK1Q15835 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRK1Q15835 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRK1Q15835 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRK1Q15835 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRK1Q15835 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRK1Q15835 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRK1Q15835 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRK1Q15835 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRK1Q15835 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRK1Q15835 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRK1Q15835 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRK1Q15835 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRK1Q15835 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRK1Q15835 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRK1Q15835 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRK1Q15835 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRK1Q15835 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRK1Q15835 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRK1Q15835 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRK1Q15835 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRK1Q15835 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRK1Q15835 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRK1Q15835 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRK1Q15835 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRK1Q15835 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRK1Q15835 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRK1Q15835 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRK1Q15835 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRK1Q15835 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRK1Q15835 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRK1Q15835 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRK1Q15835 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRK1Q15835 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRK1Q15835 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRK1Q15835 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRK1Q15835 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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