Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC1A5Q15758 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC1A5Q15758 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC1A5Q15758 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC1A5Q15758 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC1A5Q15758 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC1A5Q15758 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC1A5Q15758 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC1A5Q15758 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC1A5Q15758 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC1A5Q15758 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC1A5Q15758 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC1A5Q15758 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC1A5Q15758 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC1A5Q15758 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC1A5Q15758 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC1A5Q15758 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC1A5Q15758 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC1A5Q15758 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC1A5Q15758 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC1A5Q15758 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC1A5Q15758 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC1A5Q15758 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC1A5Q15758 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC1A5Q15758 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC1A5Q15758 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC1A5Q15758 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC1A5Q15758 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC1A5Q15758 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC1A5Q15758 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC1A5Q15758 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC1A5Q15758 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC1A5Q15758 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC1A5Q15758 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC1A5Q15758 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC1A5Q15758 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC1A5Q15758 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC1A5Q15758 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC1A5Q15758 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC1A5Q15758 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC1A5Q15758 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC1A5Q15758 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC1A5Q15758 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC1A5Q15758 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC1A5Q15758 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A5Q15758 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A5Q15758 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A5Q15758 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A5Q15758 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A5Q15758 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A5Q15758 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC1A5Q15758 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC1A5Q15758 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC1A5Q15758 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC1A5Q15758 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC1A5Q15758 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC1A5Q15758 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC1A5Q15758 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC1A5Q15758 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC1A5Q15758 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC1A5Q15758 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC1A5Q15758 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC1A5Q15758 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC1A5Q15758 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC1A5Q15758 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC1A5Q15758 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC1A5Q15758 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC1A5Q15758 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC1A5Q15758 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC1A5Q15758 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC1A5Q15758 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC1A5Q15758 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A5Q15758 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A5Q15758 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC1A5Q15758 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC1A5Q15758 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC1A5Q15758 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC1A5Q15758 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC1A5Q15758 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC1A5Q15758 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC1A5Q15758 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC1A5Q15758 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC1A5Q15758 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A5Q15758 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms