Protein–RNA interactions for Protein: Q15435

PPP1R7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R7Q15435 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R7Q15435 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R7Q15435 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R7Q15435 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R7Q15435 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R7Q15435 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R7Q15435 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R7Q15435 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R7Q15435 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R7Q15435 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R7Q15435 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R7Q15435 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R7Q15435 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP1R7Q15435 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R7Q15435 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R7Q15435 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R7Q15435 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R7Q15435 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP1R7Q15435 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP1R7Q15435 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R7Q15435 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R7Q15435 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R7Q15435 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R7Q15435 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R7Q15435 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP1R7Q15435 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R7Q15435 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R7Q15435 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R7Q15435 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R7Q15435 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R7Q15435 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R7Q15435 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R7Q15435 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP1R7Q15435 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R7Q15435 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP1R7Q15435 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R7Q15435 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R7Q15435 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R7Q15435 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R7Q15435 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R7Q15435 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R7Q15435 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R7Q15435 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R7Q15435 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP1R7Q15435 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP1R7Q15435 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP1R7Q15435 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP1R7Q15435 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R7Q15435 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PPP1R7Q15435 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R7Q15435 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R7Q15435 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R7Q15435 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R7Q15435 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R7Q15435 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R7Q15435 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R7Q15435 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R7Q15435 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R7Q15435 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PPP1R7Q15435 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PPP1R7Q15435 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP1R7Q15435 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP1R7Q15435 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R7Q15435 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R7Q15435 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R7Q15435 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R7Q15435 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R7Q15435 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R7Q15435 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R7Q15435 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R7Q15435 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R7Q15435 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms