Protein–RNA interactions for Protein: Q15363

TMED2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED2Q15363 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMED2Q15363 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMED2Q15363 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMED2Q15363 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMED2Q15363 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMED2Q15363 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMED2Q15363 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMED2Q15363 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMED2Q15363 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMED2Q15363 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMED2Q15363 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMED2Q15363 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMED2Q15363 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMED2Q15363 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMED2Q15363 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMED2Q15363 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMED2Q15363 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMED2Q15363 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMED2Q15363 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMED2Q15363 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMED2Q15363 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMED2Q15363 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMED2Q15363 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMED2Q15363 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMED2Q15363 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMED2Q15363 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMED2Q15363 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMED2Q15363 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMED2Q15363 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMED2Q15363 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMED2Q15363 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMED2Q15363 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMED2Q15363 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMED2Q15363 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMED2Q15363 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMED2Q15363 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMED2Q15363 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMED2Q15363 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMED2Q15363 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMED2Q15363 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMED2Q15363 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMED2Q15363 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMED2Q15363 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMED2Q15363 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMED2Q15363 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMED2Q15363 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMED2Q15363 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMED2Q15363 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMED2Q15363 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMED2Q15363 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMED2Q15363 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMED2Q15363 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMED2Q15363 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMED2Q15363 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMED2Q15363 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMED2Q15363 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMED2Q15363 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMED2Q15363 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMED2Q15363 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMED2Q15363 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMED2Q15363 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMED2Q15363 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMED2Q15363 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMED2Q15363 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMED2Q15363 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMED2Q15363 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMED2Q15363 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMED2Q15363 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMED2Q15363 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMED2Q15363 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMED2Q15363 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMED2Q15363 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMED2Q15363 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMED2Q15363 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMED2Q15363 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMED2Q15363 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMED2Q15363 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMED2Q15363 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMED2Q15363 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMED2Q15363 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMED2Q15363 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMED2Q15363 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMED2Q15363 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMED2Q15363 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMED2Q15363 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms