Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLD3Q15054 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD3Q15054 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD3Q15054 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
POLD3Q15054 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLD3Q15054 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLD3Q15054 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
POLD3Q15054 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD3Q15054 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD3Q15054 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD3Q15054 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD3Q15054 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD3Q15054 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD3Q15054 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD3Q15054 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD3Q15054 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD3Q15054 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD3Q15054 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD3Q15054 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD3Q15054 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD3Q15054 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD3Q15054 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD3Q15054 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD3Q15054 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD3Q15054 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD3Q15054 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD3Q15054 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD3Q15054 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD3Q15054 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD3Q15054 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLD3Q15054 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLD3Q15054 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLD3Q15054 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD3Q15054 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD3Q15054 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD3Q15054 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLD3Q15054 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD3Q15054 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD3Q15054 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD3Q15054 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLD3Q15054 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD3Q15054 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLD3Q15054 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD3Q15054 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD3Q15054 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD3Q15054 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLD3Q15054 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLD3Q15054 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLD3Q15054 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLD3Q15054 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLD3Q15054 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLD3Q15054 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLD3Q15054 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLD3Q15054 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLD3Q15054 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLD3Q15054 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLD3Q15054 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLD3Q15054 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLD3Q15054 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLD3Q15054 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLD3Q15054 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLD3Q15054 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLD3Q15054 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLD3Q15054 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POLD3Q15054 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLD3Q15054 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLD3Q15054 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLD3Q15054 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLD3Q15054 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLD3Q15054 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD3Q15054 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD3Q15054 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD3Q15054 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD3Q15054 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD3Q15054 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD3Q15054 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD3Q15054 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD3Q15054 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLD3Q15054 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
POLD3Q15054 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLD3Q15054 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLD3Q15054 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms