Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NCAPD2Q15021 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NCAPD2Q15021 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NCAPD2Q15021 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NCAPD2Q15021 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NCAPD2Q15021 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCAPD2Q15021 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCAPD2Q15021 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCAPD2Q15021 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NCAPD2Q15021 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCAPD2Q15021 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCAPD2Q15021 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCAPD2Q15021 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCAPD2Q15021 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCAPD2Q15021 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
NCAPD2Q15021 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCAPD2Q15021 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NCAPD2Q15021 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCAPD2Q15021 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NCAPD2Q15021 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NCAPD2Q15021 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NCAPD2Q15021 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCAPD2Q15021 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCAPD2Q15021 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NCAPD2Q15021 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCAPD2Q15021 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCAPD2Q15021 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCAPD2Q15021 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NCAPD2Q15021 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NCAPD2Q15021 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCAPD2Q15021 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCAPD2Q15021 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCAPD2Q15021 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCAPD2Q15021 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCAPD2Q15021 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NCAPD2Q15021 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NCAPD2Q15021 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NCAPD2Q15021 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NCAPD2Q15021 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NCAPD2Q15021 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NCAPD2Q15021 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NCAPD2Q15021 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCAPD2Q15021 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCAPD2Q15021 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCAPD2Q15021 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCAPD2Q15021 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCAPD2Q15021 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NCAPD2Q15021 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NCAPD2Q15021 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD2Q15021 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD2Q15021 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD2Q15021 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD2Q15021 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD2Q15021 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD2Q15021 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCAPD2Q15021 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCAPD2Q15021 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NCAPD2Q15021 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCAPD2Q15021 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCAPD2Q15021 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCAPD2Q15021 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCAPD2Q15021 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCAPD2Q15021 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCAPD2Q15021 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCAPD2Q15021 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCAPD2Q15021 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
NCAPD2Q15021 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NCAPD2Q15021 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NCAPD2Q15021 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
NCAPD2Q15021 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NCAPD2Q15021 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NCAPD2Q15021 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NCAPD2Q15021 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NCAPD2Q15021 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NCAPD2Q15021 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NCAPD2Q15021 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NCAPD2Q15021 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NCAPD2Q15021 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NCAPD2Q15021 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NCAPD2Q15021 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NCAPD2Q15021 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NCAPD2Q15021 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
NCAPD2Q15021 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NCAPD2Q15021 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NCAPD2Q15021 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
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