Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CBX2Q14781 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CBX2Q14781 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CBX2Q14781 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CBX2Q14781 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CBX2Q14781 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CBX2Q14781 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CBX2Q14781 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CBX2Q14781 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CBX2Q14781 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CBX2Q14781 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CBX2Q14781 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CBX2Q14781 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CBX2Q14781 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CBX2Q14781 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CBX2Q14781 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CBX2Q14781 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CBX2Q14781 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CBX2Q14781 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CBX2Q14781 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CBX2Q14781 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CBX2Q14781 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CBX2Q14781 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CBX2Q14781 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CBX2Q14781 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CBX2Q14781 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CBX2Q14781 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CBX2Q14781 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CBX2Q14781 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CBX2Q14781 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CBX2Q14781 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CBX2Q14781 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CBX2Q14781 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CBX2Q14781 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CBX2Q14781 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CBX2Q14781 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CBX2Q14781 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CBX2Q14781 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CBX2Q14781 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CBX2Q14781 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CBX2Q14781 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CBX2Q14781 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CBX2Q14781 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CBX2Q14781 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CBX2Q14781 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CBX2Q14781 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CBX2Q14781 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CBX2Q14781 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CBX2Q14781 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CBX2Q14781 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CBX2Q14781 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CBX2Q14781 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CBX2Q14781 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CBX2Q14781 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CBX2Q14781 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CBX2Q14781 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CBX2Q14781 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CBX2Q14781 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CBX2Q14781 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBX2Q14781 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBX2Q14781 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CBX2Q14781 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CBX2Q14781 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CBX2Q14781 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CBX2Q14781 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CBX2Q14781 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBX2Q14781 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBX2Q14781 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBX2Q14781 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CBX2Q14781 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CBX2Q14781 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CBX2Q14781 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CBX2Q14781 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CBX2Q14781 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CBX2Q14781 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CBX2Q14781 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBX2Q14781 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBX2Q14781 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CBX2Q14781 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CBX2Q14781 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CBX2Q14781 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CBX2Q14781 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBX2Q14781 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBX2Q14781 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBX2Q14781 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBX2Q14781 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CBX2Q14781 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CBX2Q14781 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CBX2Q14781 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CBX2Q14781 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CBX2Q14781 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CBX2Q14781 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBX2Q14781 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBX2Q14781 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CBX2Q14781 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CBX2Q14781 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CBX2Q14781 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CBX2Q14781 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CBX2Q14781 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CBX2Q14781 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
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