Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MELKQ14680 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MELKQ14680 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MELKQ14680 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MELKQ14680 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MELKQ14680 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MELKQ14680 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MELKQ14680 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MELKQ14680 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MELKQ14680 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MELKQ14680 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MELKQ14680 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MELKQ14680 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MELKQ14680 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MELKQ14680 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MELKQ14680 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MELKQ14680 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MELKQ14680 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MELKQ14680 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MELKQ14680 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MELKQ14680 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MELKQ14680 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MELKQ14680 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MELKQ14680 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MELKQ14680 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MELKQ14680 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MELKQ14680 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MELKQ14680 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MELKQ14680 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MELKQ14680 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MELKQ14680 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MELKQ14680 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MELKQ14680 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MELKQ14680 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MELKQ14680 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MELKQ14680 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MELKQ14680 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MELKQ14680 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MELKQ14680 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MELKQ14680 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MELKQ14680 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MELKQ14680 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MELKQ14680 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MELKQ14680 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MELKQ14680 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MELKQ14680 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MELKQ14680 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MELKQ14680 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MELKQ14680 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MELKQ14680 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MELKQ14680 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MELKQ14680 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MELKQ14680 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MELKQ14680 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MELKQ14680 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MELKQ14680 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MELKQ14680 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MELKQ14680 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MELKQ14680 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MELKQ14680 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MELKQ14680 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MELKQ14680 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MELKQ14680 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MELKQ14680 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MELKQ14680 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MELKQ14680 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MELKQ14680 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MELKQ14680 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MELKQ14680 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MELKQ14680 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MELKQ14680 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MELKQ14680 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MELKQ14680 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MELKQ14680 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MELKQ14680 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MELKQ14680 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MELKQ14680 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MELKQ14680 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MELKQ14680 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MELKQ14680 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MELKQ14680 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MELKQ14680 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MELKQ14680 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MELKQ14680 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MELKQ14680 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MELKQ14680 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MELKQ14680 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MELKQ14680 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MELKQ14680 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MELKQ14680 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MELKQ14680 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MELKQ14680 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MELKQ14680 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MELKQ14680 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MELKQ14680 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MELKQ14680 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MELKQ14680 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MELKQ14680 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MELKQ14680 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MELKQ14680 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms