Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNX2Q13950 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNX2Q13950 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNX2Q13950 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNX2Q13950 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNX2Q13950 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNX2Q13950 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNX2Q13950 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNX2Q13950 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNX2Q13950 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNX2Q13950 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNX2Q13950 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNX2Q13950 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNX2Q13950 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNX2Q13950 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNX2Q13950 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNX2Q13950 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNX2Q13950 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNX2Q13950 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNX2Q13950 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNX2Q13950 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNX2Q13950 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNX2Q13950 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNX2Q13950 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNX2Q13950 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNX2Q13950 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNX2Q13950 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX2Q13950 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX2Q13950 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX2Q13950 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNX2Q13950 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNX2Q13950 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNX2Q13950 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNX2Q13950 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNX2Q13950 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNX2Q13950 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNX2Q13950 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNX2Q13950 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNX2Q13950 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNX2Q13950 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNX2Q13950 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNX2Q13950 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNX2Q13950 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNX2Q13950 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNX2Q13950 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNX2Q13950 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNX2Q13950 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNX2Q13950 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNX2Q13950 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNX2Q13950 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNX2Q13950 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNX2Q13950 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNX2Q13950 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNX2Q13950 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNX2Q13950 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNX2Q13950 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNX2Q13950 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNX2Q13950 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNX2Q13950 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNX2Q13950 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNX2Q13950 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNX2Q13950 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNX2Q13950 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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