Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNTB1Q13884 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNTB1Q13884 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNTB1Q13884 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNTB1Q13884 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNTB1Q13884 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNTB1Q13884 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNTB1Q13884 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNTB1Q13884 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNTB1Q13884 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNTB1Q13884 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNTB1Q13884 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNTB1Q13884 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNTB1Q13884 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNTB1Q13884 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNTB1Q13884 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNTB1Q13884 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNTB1Q13884 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNTB1Q13884 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNTB1Q13884 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNTB1Q13884 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNTB1Q13884 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNTB1Q13884 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNTB1Q13884 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNTB1Q13884 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNTB1Q13884 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNTB1Q13884 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNTB1Q13884 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNTB1Q13884 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNTB1Q13884 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNTB1Q13884 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNTB1Q13884 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNTB1Q13884 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNTB1Q13884 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTB1Q13884 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNTB1Q13884 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNTB1Q13884 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNTB1Q13884 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNTB1Q13884 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNTB1Q13884 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNTB1Q13884 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNTB1Q13884 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNTB1Q13884 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNTB1Q13884 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms