Protein–RNA interactions for Protein: Q13459

MYO9B, Unconventional myosin-IXb, humanhuman

Predictions only

Length 2,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO9BQ13459 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MYO9BQ13459 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MYO9BQ13459 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MYO9BQ13459 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MYO9BQ13459 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MYO9BQ13459 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
MYO9BQ13459 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MYO9BQ13459 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MYO9BQ13459 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO9BQ13459 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO9BQ13459 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO9BQ13459 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO9BQ13459 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MYO9BQ13459 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
MYO9BQ13459 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MYO9BQ13459 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MYO9BQ13459 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MYO9BQ13459 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MYO9BQ13459 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MYO9BQ13459 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MYO9BQ13459 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MYO9BQ13459 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MYO9BQ13459 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MYO9BQ13459 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MYO9BQ13459 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MYO9BQ13459 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MYO9BQ13459 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MYO9BQ13459 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYO9BQ13459 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYO9BQ13459 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYO9BQ13459 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MYO9BQ13459 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MYO9BQ13459 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MYO9BQ13459 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MYO9BQ13459 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYO9BQ13459 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYO9BQ13459 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYO9BQ13459 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYO9BQ13459 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO9BQ13459 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO9BQ13459 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MYO9BQ13459 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYO9BQ13459 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYO9BQ13459 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYO9BQ13459 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYO9BQ13459 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MYO9BQ13459 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYO9BQ13459 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYO9BQ13459 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYO9BQ13459 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYO9BQ13459 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYO9BQ13459 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYO9BQ13459 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYO9BQ13459 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYO9BQ13459 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYO9BQ13459 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYO9BQ13459 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYO9BQ13459 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYO9BQ13459 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYO9BQ13459 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYO9BQ13459 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYO9BQ13459 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYO9BQ13459 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYO9BQ13459 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYO9BQ13459 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYO9BQ13459 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYO9BQ13459 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYO9BQ13459 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MYO9BQ13459 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MYO9BQ13459 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYO9BQ13459 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYO9BQ13459 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYO9BQ13459 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYO9BQ13459 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYO9BQ13459 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYO9BQ13459 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYO9BQ13459 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYO9BQ13459 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MYO9BQ13459 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYO9BQ13459 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYO9BQ13459 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MYO9BQ13459 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MYO9BQ13459 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYO9BQ13459 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYO9BQ13459 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms