Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PDE3BQ13370 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PDE3BQ13370 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PDE3BQ13370 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PDE3BQ13370 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PDE3BQ13370 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PDE3BQ13370 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PDE3BQ13370 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PDE3BQ13370 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PDE3BQ13370 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PDE3BQ13370 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PDE3BQ13370 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PDE3BQ13370 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PDE3BQ13370 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
PDE3BQ13370 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PDE3BQ13370 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PDE3BQ13370 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PDE3BQ13370 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
PDE3BQ13370 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PDE3BQ13370 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PDE3BQ13370 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PDE3BQ13370 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PDE3BQ13370 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PDE3BQ13370 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PDE3BQ13370 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PDE3BQ13370 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PDE3BQ13370 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PDE3BQ13370 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PDE3BQ13370 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PDE3BQ13370 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PDE3BQ13370 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
PDE3BQ13370 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PDE3BQ13370 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PDE3BQ13370 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PDE3BQ13370 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PDE3BQ13370 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PDE3BQ13370 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PDE3BQ13370 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PDE3BQ13370 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDE3BQ13370 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDE3BQ13370 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PDE3BQ13370 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PDE3BQ13370 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PDE3BQ13370 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PDE3BQ13370 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PDE3BQ13370 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PDE3BQ13370 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PDE3BQ13370 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PDE3BQ13370 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PDE3BQ13370 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PDE3BQ13370 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PDE3BQ13370 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PDE3BQ13370 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PDE3BQ13370 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PDE3BQ13370 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PDE3BQ13370 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PDE3BQ13370 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PDE3BQ13370 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PDE3BQ13370 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PDE3BQ13370 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PDE3BQ13370 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDE3BQ13370 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDE3BQ13370 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PDE3BQ13370 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PDE3BQ13370 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PDE3BQ13370 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PDE3BQ13370 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDE3BQ13370 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDE3BQ13370 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDE3BQ13370 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDE3BQ13370 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PDE3BQ13370 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PDE3BQ13370 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDE3BQ13370 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDE3BQ13370 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDE3BQ13370 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PDE3BQ13370 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PDE3BQ13370 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PDE3BQ13370 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PDE3BQ13370 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PDE3BQ13370 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PDE3BQ13370 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PDE3BQ13370 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PDE3BQ13370 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PDE3BQ13370 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PDE3BQ13370 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PDE3BQ13370 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PDE3BQ13370 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PDE3BQ13370 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PDE3BQ13370 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PDE3BQ13370 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PDE3BQ13370 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PDE3BQ13370 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PDE3BQ13370 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PDE3BQ13370 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PDE3BQ13370 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PDE3BQ13370 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PDE3BQ13370 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
PDE3BQ13370 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PDE3BQ13370 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
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