Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGADQ13349 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGADQ13349 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGADQ13349 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGADQ13349 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGADQ13349 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGADQ13349 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGADQ13349 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGADQ13349 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGADQ13349 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGADQ13349 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGADQ13349 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGADQ13349 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGADQ13349 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGADQ13349 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGADQ13349 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGADQ13349 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGADQ13349 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGADQ13349 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGADQ13349 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGADQ13349 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGADQ13349 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGADQ13349 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGADQ13349 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGADQ13349 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGADQ13349 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGADQ13349 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGADQ13349 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGADQ13349 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGADQ13349 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGADQ13349 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGADQ13349 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGADQ13349 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGADQ13349 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGADQ13349 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGADQ13349 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGADQ13349 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGADQ13349 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGADQ13349 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGADQ13349 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGADQ13349 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGADQ13349 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGADQ13349 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGADQ13349 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGADQ13349 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGADQ13349 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGADQ13349 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGADQ13349 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGADQ13349 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGADQ13349 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGADQ13349 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGADQ13349 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGADQ13349 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGADQ13349 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGADQ13349 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGADQ13349 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGADQ13349 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGADQ13349 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGADQ13349 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGADQ13349 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGADQ13349 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGADQ13349 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGADQ13349 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGADQ13349 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGADQ13349 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGADQ13349 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGADQ13349 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGADQ13349 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGADQ13349 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGADQ13349 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms