Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SELENBP1Q13228 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SELENBP1Q13228 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELENBP1Q13228 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELENBP1Q13228 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELENBP1Q13228 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SELENBP1Q13228 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SELENBP1Q13228 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SELENBP1Q13228 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SELENBP1Q13228 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SELENBP1Q13228 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENBP1Q13228 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENBP1Q13228 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELENBP1Q13228 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELENBP1Q13228 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENBP1Q13228 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELENBP1Q13228 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELENBP1Q13228 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELENBP1Q13228 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELENBP1Q13228 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENBP1Q13228 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SELENBP1Q13228 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SELENBP1Q13228 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SELENBP1Q13228 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SELENBP1Q13228 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SELENBP1Q13228 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SELENBP1Q13228 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SELENBP1Q13228 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SELENBP1Q13228 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENBP1Q13228 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SELENBP1Q13228 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SELENBP1Q13228 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SELENBP1Q13228 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENBP1Q13228 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SELENBP1Q13228 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENBP1Q13228 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENBP1Q13228 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENBP1Q13228 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENBP1Q13228 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENBP1Q13228 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENBP1Q13228 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENBP1Q13228 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SELENBP1Q13228 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SELENBP1Q13228 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SELENBP1Q13228 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENBP1Q13228 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms