Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 C10orf128-203ENST00000374153 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.487e-7■■■■■ 54.4
TARDBPQ13148 C10orf128-201ENST00000374148 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.587e-7■■■■■ 54.4
TARDBPQ13148 C10orf128-202ENST00000374151 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.77e-7■■■■■ 54.4
TARDBPQ13148 C10orf128-208ENST00000488276 490 ntTSL 38.17□□□□□ -1.17e-7■■■■■ 54.4
TARDBPQ13148 C10orf128-205ENST00000453436 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.57□□□□□ -1.367e-7■■■■■ 54.4
TARDBPQ13148 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.597e-7■■■■■ 54.4
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TARDBPQ13148 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.337e-54■■■■■ 54
TARDBPQ13148 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.067e-54■■■■■ 54
TARDBPQ13148 ATP6V0D1-207ENST00000563305 1656 ntTSL 514.61□□□□□ -0.077e-54■■■■■ 54
TARDBPQ13148 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.377e-54■■■■■ 54
TARDBPQ13148 ATP6V0D1-217ENST00000568620 3390 ntTSL 211.3□□□□□ -0.67e-54■■■■■ 54
TARDBPQ13148 ATP6V0D1-202ENST00000426604 1257 ntTSL 211.21□□□□□ -0.617e-54■■■■■ 54
TARDBPQ13148 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 54
TARDBPQ13148 ARHGEF1-216ENST00000598587 359 ntTSL 211.83□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 53.9
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TARDBPQ13148 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.684e-12■■■■■ 53.9
TARDBPQ13148 ROR2-208ENST00000550066 4360 ntTSL 29.74□□□□□ -0.858e-8■■■■■ 53.8
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TARDBPQ13148 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.441e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-211ENST00000530749 2558 ntTSL 220.41■□□□□ 0.861e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.831e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.671e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.121e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-203ENST00000527537 3403 ntTSL 1 (best)6.84□□□□□ -1.311e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-213ENST00000532461 3286 ntTSL 1 (best)5.43□□□□□ -1.541e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.789e-57■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.379e-57■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 CXXC5-209ENST00000507139 472 ntTSL 422.14■■□□□ 1.131e-11■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 CXXC5-206ENST00000504844 777 ntTSL 221.39■■□□□ 1.011e-11■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 CXXC5-203ENST00000502336 581 ntTSL 420.04■□□□□ 0.81e-11■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.631e-11■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.271e-11■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 CXXC5-202ENST00000502295 503 ntTSL 416.55■□□□□ 0.241e-11■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 CXXC5-214ENST00000512816 558 ntTSL 316.3■□□□□ 0.21e-11■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 CXXC5-216ENST00000520967 878 ntTSL 315.83■□□□□ 0.121e-11■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 CXXC5-207ENST00000504944 568 ntTSL 314.18□□□□□ -0.141e-11■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 RBM6-214ENST00000464013 397 ntTSL 54.92□□□□□ -1.624e-8■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.37□□□□□ -0.272e-15■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 SCAP-203ENST00000416208 1222 ntTSL 519.18■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.183e-8■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 SCAP-202ENST00000320017 3430 ntTSL 214.76□□□□□ -0.053e-8■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 SCAP-207ENST00000441517 3748 ntTSL 214.48□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 53.6
TARDBPQ13148 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 53.6
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TARDBPQ13148 GUK1-235ENST00000493138 694 ntTSL 325.33■■□□□ 1.653e-8■■■■■ 52.6
TARDBPQ13148 GUK1-227ENST00000485083 871 ntTSL 325.33■■□□□ 1.653e-8■■■■■ 52.6
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TARDBPQ13148 GUK1-233ENST00000491613 959 ntTSL 313.38□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 52.6
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TARDBPQ13148 GUK1-229ENST00000485733 345 ntTSL 312.04□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 52.6
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TARDBPQ13148 ARHGEF1-218ENST00000599589 2636 ntTSL 1 (best)18.53■□□□□ 0.566e-8■■■■■ 52.5
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TARDBPQ13148 ARHGEF1-211ENST00000595723 872 ntTSL 515.74■□□□□ 0.116e-8■■■■■ 52.5
TARDBPQ13148 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.036e-8■■■■■ 52.5
TARDBPQ13148 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.016e-8■■■■■ 52.5
TARDBPQ13148 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.216e-8■■■■■ 52.5
TARDBPQ13148 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.236e-8■■■■■ 52.5
TARDBPQ13148 ARHGEF1-222ENST00000600517 428 ntTSL 313.39□□□□□ -0.276e-8■■■■■ 52.5
TARDBPQ13148 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.426e-8■■■■■ 52.5
TARDBPQ13148 ARHGEF1-220ENST00000600274 3439 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.666e-8■■■■■ 52.5
TARDBPQ13148 HECTD4-213ENST00000550968 2313 ntTSL 210.51□□□□□ -0.732e-12■■■■■ 52.5
TARDBPQ13148 HM13-219ENST00000487964 902 ntTSL 516.4■□□□□ 0.223e-30■■■■■ 52.3
TARDBPQ13148 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.093e-30■■■■■ 52.3
TARDBPQ13148 HM13-220ENST00000492709 1248 ntTSL 515.57■□□□□ 0.083e-30■■■■■ 52.3
TARDBPQ13148 HM13-208ENST00000464508 855 ntTSL 215.35■□□□□ 0.053e-30■■■■■ 52.3
TARDBPQ13148 HM13-213ENST00000469126 756 ntTSL 515.21■□□□□ 0.033e-30■■■■■ 52.3
TARDBPQ13148 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.143e-30■■■■■ 52.3
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TARDBPQ13148 HM13-205ENST00000460225 443 ntTSL 513.85□□□□□ -0.193e-30■■■■■ 52.3
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TARDBPQ13148 HM13-223ENST00000496438 699 ntTSL 511.59□□□□□ -0.553e-30■■■■■ 52.3
TARDBPQ13148 HM13-204ENST00000398174 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.653e-30■■■■■ 52.3
TARDBPQ13148 HM13-216ENST00000479096 598 ntTSL 310.62□□□□□ -0.713e-30■■■■■ 52.3
TARDBPQ13148 TMEM74B-202ENST00000429036 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.22■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 52.2
TARDBPQ13148 GART-212ENST00000466882 654 ntTSL 310.96□□□□□ -0.651e-17■■■■■ 52.1
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