Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXF1Q12946 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXF1Q12946 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXF1Q12946 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXF1Q12946 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXF1Q12946 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXF1Q12946 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXF1Q12946 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXF1Q12946 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXF1Q12946 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXF1Q12946 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXF1Q12946 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXF1Q12946 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXF1Q12946 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXF1Q12946 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXF1Q12946 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXF1Q12946 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXF1Q12946 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXF1Q12946 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXF1Q12946 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXF1Q12946 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXF1Q12946 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXF1Q12946 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXF1Q12946 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXF1Q12946 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXF1Q12946 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXF1Q12946 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXF1Q12946 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXF1Q12946 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXF1Q12946 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXF1Q12946 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXF1Q12946 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXF1Q12946 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXF1Q12946 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXF1Q12946 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXF1Q12946 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXF1Q12946 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXF1Q12946 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXF1Q12946 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXF1Q12946 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXF1Q12946 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXF1Q12946 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXF1Q12946 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXF1Q12946 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXF1Q12946 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXF1Q12946 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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