Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAA2

LRRC74A, Leucine-rich repeat-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC74AQ0VAA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC74AQ0VAA2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC74AQ0VAA2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC74AQ0VAA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC74AQ0VAA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC74AQ0VAA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC74AQ0VAA2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC74AQ0VAA2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms