Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAA2

LRRC74A, Leucine-rich repeat-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC74AQ0VAA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC74AQ0VAA2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC74AQ0VAA2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC74AQ0VAA2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC74AQ0VAA2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC74AQ0VAA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC74AQ0VAA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC74AQ0VAA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC74AQ0VAA2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC74AQ0VAA2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC74AQ0VAA2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC74AQ0VAA2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC74AQ0VAA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC74AQ0VAA2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms