Protein–RNA interactions for Protein: Q08AN1

ZNF616, Zinc finger protein 616, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF616Q08AN1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF616Q08AN1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF616Q08AN1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF616Q08AN1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF616Q08AN1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF616Q08AN1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF616Q08AN1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF616Q08AN1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF616Q08AN1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF616Q08AN1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF616Q08AN1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF616Q08AN1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF616Q08AN1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF616Q08AN1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF616Q08AN1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF616Q08AN1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF616Q08AN1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF616Q08AN1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF616Q08AN1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF616Q08AN1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF616Q08AN1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF616Q08AN1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF616Q08AN1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF616Q08AN1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF616Q08AN1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF616Q08AN1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF616Q08AN1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF616Q08AN1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF616Q08AN1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF616Q08AN1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF616Q08AN1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF616Q08AN1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF616Q08AN1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF616Q08AN1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF616Q08AN1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF616Q08AN1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF616Q08AN1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF616Q08AN1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF616Q08AN1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF616Q08AN1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF616Q08AN1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF616Q08AN1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF616Q08AN1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF616Q08AN1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF616Q08AN1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF616Q08AN1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF616Q08AN1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF616Q08AN1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF616Q08AN1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF616Q08AN1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF616Q08AN1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF616Q08AN1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF616Q08AN1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms