Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DEUP1Q05D60 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DEUP1Q05D60 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DEUP1Q05D60 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DEUP1Q05D60 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DEUP1Q05D60 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DEUP1Q05D60 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DEUP1Q05D60 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DEUP1Q05D60 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DEUP1Q05D60 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DEUP1Q05D60 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DEUP1Q05D60 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DEUP1Q05D60 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DEUP1Q05D60 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DEUP1Q05D60 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DEUP1Q05D60 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DEUP1Q05D60 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DEUP1Q05D60 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DEUP1Q05D60 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DEUP1Q05D60 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DEUP1Q05D60 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DEUP1Q05D60 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DEUP1Q05D60 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DEUP1Q05D60 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DEUP1Q05D60 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DEUP1Q05D60 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DEUP1Q05D60 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DEUP1Q05D60 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DEUP1Q05D60 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DEUP1Q05D60 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DEUP1Q05D60 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DEUP1Q05D60 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DEUP1Q05D60 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DEUP1Q05D60 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DEUP1Q05D60 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DEUP1Q05D60 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DEUP1Q05D60 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEUP1Q05D60 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DEUP1Q05D60 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEUP1Q05D60 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEUP1Q05D60 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEUP1Q05D60 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DEUP1Q05D60 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DEUP1Q05D60 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DEUP1Q05D60 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DEUP1Q05D60 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DEUP1Q05D60 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DEUP1Q05D60 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DEUP1Q05D60 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DEUP1Q05D60 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
DEUP1Q05D60 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DEUP1Q05D60 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DEUP1Q05D60 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DEUP1Q05D60 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DEUP1Q05D60 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DEUP1Q05D60 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DEUP1Q05D60 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DEUP1Q05D60 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DEUP1Q05D60 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DEUP1Q05D60 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DEUP1Q05D60 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.8 ms