Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNC4Q03721 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNC4Q03721 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNC4Q03721 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNC4Q03721 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNC4Q03721 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNC4Q03721 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNC4Q03721 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNC4Q03721 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNC4Q03721 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNC4Q03721 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNC4Q03721 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNC4Q03721 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNC4Q03721 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNC4Q03721 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNC4Q03721 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNC4Q03721 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNC4Q03721 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNC4Q03721 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNC4Q03721 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNC4Q03721 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNC4Q03721 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNC4Q03721 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNC4Q03721 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNC4Q03721 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNC4Q03721 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNC4Q03721 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNC4Q03721 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNC4Q03721 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNC4Q03721 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNC4Q03721 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNC4Q03721 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNC4Q03721 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms