Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CLTCQ00610 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CLTCQ00610 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CLTCQ00610 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CLTCQ00610 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
CLTCQ00610 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CLTCQ00610 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CLTCQ00610 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CLTCQ00610 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CLTCQ00610 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CLTCQ00610 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
CLTCQ00610 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
CLTCQ00610 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CLTCQ00610 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CLTCQ00610 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CLTCQ00610 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CLTCQ00610 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CLTCQ00610 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CLTCQ00610 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CLTCQ00610 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
CLTCQ00610 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
CLTCQ00610 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CLTCQ00610 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CLTCQ00610 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CLTCQ00610 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CLTCQ00610 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CLTCQ00610 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CLTCQ00610 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CLTCQ00610 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CLTCQ00610 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CLTCQ00610 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CLTCQ00610 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CLTCQ00610 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CLTCQ00610 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
CLTCQ00610 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CLTCQ00610 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CLTCQ00610 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CLTCQ00610 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CLTCQ00610 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CLTCQ00610 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.63■■■■■ 4.1
CLTCQ00610 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CLTCQ00610 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CLTCQ00610 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CLTCQ00610 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CLTCQ00610 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CLTCQ00610 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CLTCQ00610 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CLTCQ00610 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CLTCQ00610 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
CLTCQ00610 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CLTCQ00610 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CLTCQ00610 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
CLTCQ00610 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CLTCQ00610 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CLTCQ00610 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
CLTCQ00610 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CLTCQ00610 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CLTCQ00610 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CLTCQ00610 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CLTCQ00610 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CLTCQ00610 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CLTCQ00610 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
CLTCQ00610 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
CLTCQ00610 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
CLTCQ00610 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CLTCQ00610 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CLTCQ00610 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CLTCQ00610 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CLTCQ00610 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CLTCQ00610 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CLTCQ00610 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CLTCQ00610 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CLTCQ00610 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CLTCQ00610 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CLTCQ00610 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CLTCQ00610 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CLTCQ00610 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CLTCQ00610 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CLTCQ00610 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CLTCQ00610 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CLTCQ00610 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CLTCQ00610 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CLTCQ00610 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CLTCQ00610 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CLTCQ00610 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CLTCQ00610 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CLTCQ00610 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CLTCQ00610 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CLTCQ00610 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CLTCQ00610 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CLTCQ00610 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CLTCQ00610 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CLTCQ00610 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CLTCQ00610 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CLTCQ00610 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CLTCQ00610 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CLTCQ00610 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CLTCQ00610 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
CLTCQ00610 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
CLTCQ00610 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms