Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFI35P80217 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFI35P80217 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFI35P80217 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFI35P80217 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFI35P80217 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFI35P80217 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFI35P80217 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFI35P80217 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFI35P80217 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFI35P80217 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFI35P80217 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFI35P80217 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IFI35P80217 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFI35P80217 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFI35P80217 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFI35P80217 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
IFI35P80217 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFI35P80217 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFI35P80217 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFI35P80217 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFI35P80217 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFI35P80217 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFI35P80217 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFI35P80217 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFI35P80217 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFI35P80217 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFI35P80217 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IFI35P80217 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFI35P80217 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFI35P80217 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFI35P80217 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFI35P80217 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFI35P80217 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFI35P80217 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFI35P80217 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFI35P80217 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFI35P80217 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFI35P80217 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IFI35P80217 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IFI35P80217 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFI35P80217 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFI35P80217 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFI35P80217 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFI35P80217 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFI35P80217 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFI35P80217 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFI35P80217 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFI35P80217 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFI35P80217 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFI35P80217 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFI35P80217 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFI35P80217 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFI35P80217 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFI35P80217 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFI35P80217 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFI35P80217 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFI35P80217 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFI35P80217 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFI35P80217 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFI35P80217 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
IFI35P80217 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFI35P80217 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFI35P80217 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFI35P80217 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
IFI35P80217 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFI35P80217 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFI35P80217 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
IFI35P80217 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFI35P80217 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFI35P80217 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFI35P80217 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFI35P80217 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFI35P80217 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFI35P80217 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFI35P80217 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFI35P80217 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFI35P80217 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFI35P80217 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFI35P80217 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFI35P80217 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFI35P80217 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFI35P80217 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFI35P80217 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFI35P80217 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
IFI35P80217 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFI35P80217 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFI35P80217 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFI35P80217 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFI35P80217 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFI35P80217 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFI35P80217 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFI35P80217 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFI35P80217 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFI35P80217 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFI35P80217 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFI35P80217 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFI35P80217 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
IFI35P80217 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFI35P80217 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms