Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPC5P78333 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GPC5P78333 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GPC5P78333 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPC5P78333 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPC5P78333 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPC5P78333 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPC5P78333 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GPC5P78333 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPC5P78333 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPC5P78333 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPC5P78333 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPC5P78333 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPC5P78333 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPC5P78333 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPC5P78333 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPC5P78333 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPC5P78333 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GPC5P78333 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPC5P78333 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GPC5P78333 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPC5P78333 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPC5P78333 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPC5P78333 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPC5P78333 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC5P78333 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC5P78333 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC5P78333 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC5P78333 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GPC5P78333 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPC5P78333 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPC5P78333 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPC5P78333 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GPC5P78333 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPC5P78333 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPC5P78333 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPC5P78333 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPC5P78333 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPC5P78333 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPC5P78333 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GPC5P78333 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPC5P78333 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPC5P78333 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPC5P78333 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPC5P78333 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPC5P78333 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPC5P78333 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPC5P78333 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPC5P78333 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPC5P78333 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GPC5P78333 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPC5P78333 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPC5P78333 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPC5P78333 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPC5P78333 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPC5P78333 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPC5P78333 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPC5P78333 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPC5P78333 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPC5P78333 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPC5P78333 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPC5P78333 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPC5P78333 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPC5P78333 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPC5P78333 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
GPC5P78333 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPC5P78333 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPC5P78333 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPC5P78333 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPC5P78333 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPC5P78333 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPC5P78333 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPC5P78333 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPC5P78333 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPC5P78333 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPC5P78333 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPC5P78333 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPC5P78333 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPC5P78333 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPC5P78333 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPC5P78333 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPC5P78333 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPC5P78333 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPC5P78333 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPC5P78333 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPC5P78333 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPC5P78333 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GPC5P78333 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPC5P78333 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPC5P78333 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPC5P78333 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPC5P78333 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPC5P78333 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GPC5P78333 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPC5P78333 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPC5P78333 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPC5P78333 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPC5P78333 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPC5P78333 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GPC5P78333 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms