Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FAM193AP78312 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FAM193AP78312 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM193AP78312 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM193AP78312 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM193AP78312 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM193AP78312 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM193AP78312 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM193AP78312 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM193AP78312 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM193AP78312 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM193AP78312 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM193AP78312 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM193AP78312 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM193AP78312 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM193AP78312 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM193AP78312 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM193AP78312 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM193AP78312 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM193AP78312 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM193AP78312 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM193AP78312 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM193AP78312 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM193AP78312 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM193AP78312 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM193AP78312 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM193AP78312 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM193AP78312 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM193AP78312 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM193AP78312 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM193AP78312 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM193AP78312 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM193AP78312 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM193AP78312 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM193AP78312 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM193AP78312 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM193AP78312 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM193AP78312 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FAM193AP78312 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM193AP78312 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM193AP78312 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM193AP78312 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM193AP78312 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM193AP78312 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM193AP78312 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM193AP78312 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM193AP78312 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM193AP78312 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM193AP78312 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM193AP78312 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM193AP78312 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM193AP78312 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM193AP78312 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM193AP78312 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM193AP78312 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM193AP78312 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM193AP78312 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM193AP78312 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM193AP78312 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM193AP78312 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM193AP78312 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM193AP78312 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM193AP78312 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM193AP78312 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM193AP78312 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM193AP78312 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms