Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK2A1P68400 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK2A1P68400 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK2A1P68400 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK2A1P68400 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK2A1P68400 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK2A1P68400 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK2A1P68400 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSNK2A1P68400 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK2A1P68400 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK2A1P68400 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK2A1P68400 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK2A1P68400 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK2A1P68400 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSNK2A1P68400 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSNK2A1P68400 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK2A1P68400 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK2A1P68400 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK2A1P68400 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK2A1P68400 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK2A1P68400 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK2A1P68400 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK2A1P68400 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK2A1P68400 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK2A1P68400 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSNK2A1P68400 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK2A1P68400 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK2A1P68400 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK2A1P68400 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK2A1P68400 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK2A1P68400 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK2A1P68400 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK2A1P68400 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK2A1P68400 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK2A1P68400 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CSNK2A1P68400 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSNK2A1P68400 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK2A1P68400 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK2A1P68400 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK2A1P68400 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK2A1P68400 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK2A1P68400 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK2A1P68400 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK2A1P68400 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK2A1P68400 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK2A1P68400 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK2A1P68400 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK2A1P68400 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSNK2A1P68400 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSNK2A1P68400 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSNK2A1P68400 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK2A1P68400 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSNK2A1P68400 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK2A1P68400 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK2A1P68400 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK2A1P68400 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK2A1P68400 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK2A1P68400 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK2A1P68400 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK2A1P68400 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK2A1P68400 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK2A1P68400 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK2A1P68400 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms