Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTA1P68133 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTA1P68133 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTA1P68133 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTA1P68133 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTA1P68133 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTA1P68133 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTA1P68133 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTA1P68133 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTA1P68133 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTA1P68133 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTA1P68133 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTA1P68133 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTA1P68133 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTA1P68133 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTA1P68133 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTA1P68133 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTA1P68133 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTA1P68133 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTA1P68133 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTA1P68133 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTA1P68133 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTA1P68133 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTA1P68133 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTA1P68133 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTA1P68133 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTA1P68133 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTA1P68133 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTA1P68133 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTA1P68133 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTA1P68133 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTA1P68133 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTA1P68133 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTA1P68133 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTA1P68133 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTA1P68133 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTA1P68133 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTA1P68133 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTA1P68133 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTA1P68133 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTA1P68133 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTA1P68133 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTA1P68133 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTA1P68133 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTA1P68133 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTA1P68133 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTA1P68133 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTA1P68133 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTA1P68133 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTA1P68133 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTA1P68133 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTA1P68133 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTA1P68133 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTA1P68133 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTA1P68133 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTA1P68133 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTA1P68133 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTA1P68133 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTA1P68133 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTA1P68133 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTA1P68133 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTA1P68133 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTA1P68133 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTA1P68133 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTA1P68133 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTA1P68133 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTA1P68133 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTA1P68133 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTA1P68133 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTA1P68133 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTA1P68133 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms