Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERVK-24P63145 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERVK-24P63145 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERVK-24P63145 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ERVK-24P63145 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ERVK-24P63145 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ERVK-24P63145 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ERVK-24P63145 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ERVK-24P63145 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ERVK-24P63145 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ERVK-24P63145 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ERVK-24P63145 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
ERVK-24P63145 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERVK-24P63145 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERVK-24P63145 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERVK-24P63145 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERVK-24P63145 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ERVK-24P63145 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ERVK-24P63145 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ERVK-24P63145 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERVK-24P63145 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERVK-24P63145 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERVK-24P63145 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERVK-24P63145 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERVK-24P63145 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ERVK-24P63145 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ERVK-24P63145 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ERVK-24P63145 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ERVK-24P63145 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
ERVK-24P63145 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ERVK-24P63145 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERVK-24P63145 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERVK-24P63145 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERVK-24P63145 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERVK-24P63145 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERVK-24P63145 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERVK-24P63145 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERVK-24P63145 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ERVK-24P63145 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ERVK-24P63145 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ERVK-24P63145 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ERVK-24P63145 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ERVK-24P63145 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ERVK-24P63145 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ERVK-24P63145 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ERVK-24P63145 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ERVK-24P63145 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ERVK-24P63145 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ERVK-24P63145 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ERVK-24P63145 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ERVK-24P63145 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERVK-24P63145 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERVK-24P63145 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERVK-24P63145 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ERVK-24P63145 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms