Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBP62745 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOBP62745 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOBP62745 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOBP62745 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOBP62745 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOBP62745 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOBP62745 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOBP62745 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOBP62745 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOBP62745 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOBP62745 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOBP62745 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOBP62745 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOBP62745 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOBP62745 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOBP62745 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOBP62745 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOBP62745 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOBP62745 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOBP62745 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOBP62745 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOBP62745 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOBP62745 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOBP62745 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOBP62745 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOBP62745 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOBP62745 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOBP62745 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOBP62745 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOBP62745 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOBP62745 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOBP62745 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOBP62745 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOBP62745 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOBP62745 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOBP62745 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOBP62745 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOBP62745 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOBP62745 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOBP62745 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOBP62745 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOBP62745 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOBP62745 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOBP62745 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOBP62745 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOBP62745 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOBP62745 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOBP62745 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOBP62745 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOBP62745 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOBP62745 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOBP62745 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHOBP62745 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHOBP62745 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOBP62745 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOBP62745 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOBP62745 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOBP62745 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOBP62745 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOBP62745 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOBP62745 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOBP62745 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOBP62745 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOBP62745 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOBP62745 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOBP62745 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOBP62745 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOBP62745 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOBP62745 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOBP62745 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOBP62745 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOBP62745 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOBP62745 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOBP62745 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHOBP62745 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHOBP62745 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHOBP62745 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHOBP62745 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHOBP62745 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHOBP62745 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RHOBP62745 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHOBP62745 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHOBP62745 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHOBP62745 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHOBP62745 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOBP62745 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOBP62745 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOBP62745 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOBP62745 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOBP62745 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOBP62745 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOBP62745 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOBP62745 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOBP62745 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOBP62745 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOBP62745 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOBP62745 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOBP62745 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOBP62745 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms