Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPD3P62318 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPD3P62318 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPD3P62318 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPD3P62318 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPD3P62318 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPD3P62318 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNRPD3P62318 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPD3P62318 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPD3P62318 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPD3P62318 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPD3P62318 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPD3P62318 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPD3P62318 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD3P62318 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPD3P62318 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPD3P62318 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNRPD3P62318 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNRPD3P62318 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPD3P62318 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPD3P62318 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPD3P62318 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPD3P62318 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPD3P62318 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPD3P62318 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD3P62318 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPD3P62318 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPD3P62318 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPD3P62318 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD3P62318 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPD3P62318 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD3P62318 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD3P62318 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD3P62318 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPD3P62318 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNRPD3P62318 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms