Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1BP61266 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1BP61266 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1BP61266 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1BP61266 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1BP61266 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1BP61266 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1BP61266 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1BP61266 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1BP61266 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1BP61266 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
STX1BP61266 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX1BP61266 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX1BP61266 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX1BP61266 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX1BP61266 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX1BP61266 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX1BP61266 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX1BP61266 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX1BP61266 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STX1BP61266 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STX1BP61266 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
STX1BP61266 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
STX1BP61266 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
STX1BP61266 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX1BP61266 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX1BP61266 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX1BP61266 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX1BP61266 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX1BP61266 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX1BP61266 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX1BP61266 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX1BP61266 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STX1BP61266 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STX1BP61266 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1BP61266 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1BP61266 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1BP61266 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STX1BP61266 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STX1BP61266 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STX1BP61266 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STX1BP61266 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STX1BP61266 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STX1BP61266 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STX1BP61266 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STX1BP61266 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STX1BP61266 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STX1BP61266 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STX1BP61266 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
STX1BP61266 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STX1BP61266 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STX1BP61266 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STX1BP61266 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
STX1BP61266 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STX1BP61266 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STX1BP61266 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STX1BP61266 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX1BP61266 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STX1BP61266 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STX1BP61266 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STX1BP61266 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
STX1BP61266 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STX1BP61266 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STX1BP61266 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STX1BP61266 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX1BP61266 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX1BP61266 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STX1BP61266 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
STX1BP61266 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX1BP61266 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX1BP61266 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
STX1BP61266 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX1BP61266 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STX1BP61266 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STX1BP61266 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1BP61266 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1BP61266 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1BP61266 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1BP61266 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STX1BP61266 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STX1BP61266 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STX1BP61266 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STX1BP61266 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STX1BP61266 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STX1BP61266 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STX1BP61266 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STX1BP61266 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STX1BP61266 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STX1BP61266 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STX1BP61266 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STX1BP61266 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
STX1BP61266 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STX1BP61266 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STX1BP61266 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STX1BP61266 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STX1BP61266 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STX1BP61266 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STX1BP61266 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STX1BP61266 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STX1BP61266 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms