Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPS1P60891 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPS1P60891 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPS1P60891 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS1P60891 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS1P60891 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPS1P60891 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPS1P60891 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPS1P60891 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPS1P60891 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPS1P60891 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPS1P60891 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPS1P60891 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPS1P60891 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPS1P60891 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPS1P60891 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPS1P60891 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPS1P60891 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPS1P60891 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPS1P60891 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPS1P60891 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPS1P60891 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPS1P60891 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPS1P60891 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPS1P60891 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPS1P60891 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPS1P60891 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPS1P60891 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPS1P60891 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPS1P60891 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPS1P60891 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPS1P60891 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPS1P60891 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPS1P60891 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPS1P60891 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPS1P60891 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPS1P60891 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPS1P60891 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPS1P60891 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPS1P60891 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPS1P60891 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPS1P60891 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPS1P60891 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPS1P60891 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPS1P60891 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPS1P60891 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPS1P60891 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPS1P60891 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPS1P60891 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPS1P60891 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPS1P60891 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPS1P60891 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPS1P60891 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms