Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FXYD4P59646 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXYD4P59646 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FXYD4P59646 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FXYD4P59646 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FXYD4P59646 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXYD4P59646 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FXYD4P59646 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FXYD4P59646 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FXYD4P59646 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FXYD4P59646 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FXYD4P59646 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FXYD4P59646 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FXYD4P59646 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FXYD4P59646 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FXYD4P59646 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FXYD4P59646 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FXYD4P59646 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FXYD4P59646 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FXYD4P59646 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FXYD4P59646 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FXYD4P59646 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FXYD4P59646 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FXYD4P59646 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FXYD4P59646 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FXYD4P59646 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FXYD4P59646 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FXYD4P59646 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FXYD4P59646 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FXYD4P59646 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FXYD4P59646 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FXYD4P59646 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FXYD4P59646 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FXYD4P59646 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FXYD4P59646 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FXYD4P59646 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FXYD4P59646 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FXYD4P59646 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FXYD4P59646 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FXYD4P59646 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FXYD4P59646 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FXYD4P59646 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FXYD4P59646 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FXYD4P59646 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FXYD4P59646 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FXYD4P59646 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FXYD4P59646 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FXYD4P59646 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FXYD4P59646 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FXYD4P59646 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FXYD4P59646 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms