Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP5EP56381 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5EP56381 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5EP56381 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5EP56381 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5EP56381 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5EP56381 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5EP56381 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5EP56381 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5EP56381 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5EP56381 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5EP56381 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5EP56381 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5EP56381 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5EP56381 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5EP56381 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5EP56381 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms