Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUMO3P55854 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUMO3P55854 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUMO3P55854 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SUMO3P55854 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SUMO3P55854 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUMO3P55854 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUMO3P55854 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUMO3P55854 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUMO3P55854 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUMO3P55854 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUMO3P55854 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUMO3P55854 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUMO3P55854 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUMO3P55854 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUMO3P55854 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUMO3P55854 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUMO3P55854 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUMO3P55854 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUMO3P55854 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUMO3P55854 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUMO3P55854 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUMO3P55854 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SUMO3P55854 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUMO3P55854 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUMO3P55854 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUMO3P55854 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUMO3P55854 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUMO3P55854 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUMO3P55854 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUMO3P55854 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUMO3P55854 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUMO3P55854 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUMO3P55854 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUMO3P55854 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUMO3P55854 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUMO3P55854 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SUMO3P55854 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUMO3P55854 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUMO3P55854 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUMO3P55854 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUMO3P55854 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUMO3P55854 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUMO3P55854 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUMO3P55854 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUMO3P55854 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUMO3P55854 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms