Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NAP1L1P55209 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NAP1L1P55209 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NAP1L1P55209 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NAP1L1P55209 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NAP1L1P55209 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NAP1L1P55209 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NAP1L1P55209 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NAP1L1P55209 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NAP1L1P55209 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NAP1L1P55209 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NAP1L1P55209 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NAP1L1P55209 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NAP1L1P55209 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NAP1L1P55209 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NAP1L1P55209 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NAP1L1P55209 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NAP1L1P55209 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NAP1L1P55209 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NAP1L1P55209 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NAP1L1P55209 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NAP1L1P55209 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NAP1L1P55209 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NAP1L1P55209 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NAP1L1P55209 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NAP1L1P55209 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NAP1L1P55209 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NAP1L1P55209 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NAP1L1P55209 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NAP1L1P55209 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NAP1L1P55209 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NAP1L1P55209 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NAP1L1P55209 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NAP1L1P55209 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NAP1L1P55209 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NAP1L1P55209 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NAP1L1P55209 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NAP1L1P55209 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NAP1L1P55209 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NAP1L1P55209 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NAP1L1P55209 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NAP1L1P55209 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NAP1L1P55209 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NAP1L1P55209 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NAP1L1P55209 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NAP1L1P55209 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NAP1L1P55209 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NAP1L1P55209 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NAP1L1P55209 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NAP1L1P55209 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NAP1L1P55209 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NAP1L1P55209 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NAP1L1P55209 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NAP1L1P55209 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NAP1L1P55209 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NAP1L1P55209 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NAP1L1P55209 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NAP1L1P55209 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NAP1L1P55209 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NAP1L1P55209 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NAP1L1P55209 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NAP1L1P55209 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NAP1L1P55209 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NAP1L1P55209 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NAP1L1P55209 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NAP1L1P55209 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NAP1L1P55209 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NAP1L1P55209 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NAP1L1P55209 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NAP1L1P55209 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NAP1L1P55209 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NAP1L1P55209 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NAP1L1P55209 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NAP1L1P55209 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NAP1L1P55209 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NAP1L1P55209 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NAP1L1P55209 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NAP1L1P55209 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NAP1L1P55209 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NAP1L1P55209 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NAP1L1P55209 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms