Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MFAP3P55082 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MFAP3P55082 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MFAP3P55082 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MFAP3P55082 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MFAP3P55082 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MFAP3P55082 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MFAP3P55082 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MFAP3P55082 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MFAP3P55082 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MFAP3P55082 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MFAP3P55082 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MFAP3P55082 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MFAP3P55082 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MFAP3P55082 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MFAP3P55082 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MFAP3P55082 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MFAP3P55082 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MFAP3P55082 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MFAP3P55082 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MFAP3P55082 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MFAP3P55082 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MFAP3P55082 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MFAP3P55082 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MFAP3P55082 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MFAP3P55082 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MFAP3P55082 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MFAP3P55082 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MFAP3P55082 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MFAP3P55082 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MFAP3P55082 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MFAP3P55082 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MFAP3P55082 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MFAP3P55082 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MFAP3P55082 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MFAP3P55082 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MFAP3P55082 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MFAP3P55082 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MFAP3P55082 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MFAP3P55082 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MFAP3P55082 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MFAP3P55082 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MFAP3P55082 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MFAP3P55082 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MFAP3P55082 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MFAP3P55082 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
MFAP3P55082 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MFAP3P55082 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MFAP3P55082 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MFAP3P55082 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MFAP3P55082 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MFAP3P55082 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MFAP3P55082 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MFAP3P55082 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MFAP3P55082 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MFAP3P55082 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MFAP3P55082 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MFAP3P55082 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MFAP3P55082 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MFAP3P55082 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MFAP3P55082 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MFAP3P55082 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MFAP3P55082 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MFAP3P55082 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MFAP3P55082 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MFAP3P55082 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MFAP3P55082 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MFAP3P55082 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MFAP3P55082 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MFAP3P55082 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MFAP3P55082 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MFAP3P55082 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MFAP3P55082 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MFAP3P55082 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MFAP3P55082 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MFAP3P55082 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MFAP3P55082 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MFAP3P55082 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MFAP3P55082 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MFAP3P55082 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MFAP3P55082 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MFAP3P55082 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms